甲山自然学習館は、2004年10月に設立されました。
館内では甲山の自然のことが学べます。
・甲山の太古からの成り立ち
・甲山や湿原の昆虫や植物、野鳥たち
これらをパネルや標本、生きた生物などを目で見て体験できます。
また、季節に応じた生物の紹介や自然につながるイベントも開催しています。

甲山自然学習館は、自然エコハウスとも呼ばれるほど環境に配慮をしています。
床には徳島の杉を利用し海外ものに比べてコストカット。
冬にはソーラーパネルであたたかい空気を送り、夏は地下の涼しい空気を送っています。
雨水を貯め、掃除や水やりなどにも利用しています。